城都聯盟
118.若葉鎮，吹起開始之風的城鎮！
119.投手的菊草葉
120.赫拉克羅斯對抗大甲（小智收服赫拉克羅斯）
121.頓甲之谷
122.咕咕跟迷惑森林
123.美麗花的戰鬥之舞
124.線球大搜尋線
125.布盧的華麗生活
126.驚角鹿，幻影森林
127.好勝的菊草葉（小智收服菊草葉）
128.沼王和gs球
129.芭瓢蟲之笛
130.幸福蛋的快樂護士
131.喇叭芽之塔大危機
132.桔梗道館，空中大戰（小智得到飛翼徽章）
133.愛哭鬼瑪力露
134.暴走，尾立和波克比
135.再見了噴火龍，直到下一次重逢！（小智的噴火龍離隊）
136.向日花怪會場大恐慌
137.菊草葉不高興了
.毽子草飛跑了！大草原之戰！
139.神秘超級英雄，天蠍人登場
140.咩利羊和牧場的少女
141.巨鉗螳螂對抗赫拉克羅斯
142.收服火球鼠（小智收服火球鼠）
143.檜皮鎮的呆呆獸之井
144.榛果球與圓柑果實，後山之戰！（小剛收服榛果球）
145.檜皮道館，森林的戰鬥場地（小智得到昆蟲徽章）
146.黑暗森林，尋找大蔥鴨
147.果然翁與神奇寶貝交換會（武藏的大舌頭交換到果然翁，小智的肯泰羅歸隊，赫拉克羅斯離隊）
148.傑尼龜隊燃燒鬥志！像火一樣（小智的傑尼龜、肯泰羅離隊）
149.好多烏波
150.胖丁對抗布盧
151.黑暗神奇寶貝，戴魯比
152.小鋸鱷是誰的？小智對抗小霞（小智收服小鋸鱷，小霞的蚊香蝌蚪進化成蚊香蛙）
153.對抗盔甲鳥，鋼翼
154.小鋸鱷，跳出愛的舞步
155.抓到漂亮的貓頭夜鷹（小智收服貓頭夜鷹）
156.圈圈熊嚇死人
157.麒麟奇，超能力神奇寶貝之村
158.占卜大混戰
159.滿金道館，速度與力量
160.大.奶罐，復仇之戰（小智得到正式徽章）
161.收訊塔的戰鬥，超越時空
162.捕蟲大會在自然公園收服他！
163.胡說樹在哪裡？
164.古代神奇寶貝公園阿露福遺蹟
165.**屋的傳信**
166.超音蝠之館危險的迷宮（小剛的超音蝠進化大嘴蝠）
167.柯波朗對抗妙蛙種子格鬥大對決
168.叢林的三隻溫泉戰鬥
169.金魚王，釣魚戰鬥
170.再見了六尾，神奇寶貝選美大賽（小剛的六尾離隊）
171.壺壺對抗喇叭芽
172.月精靈黑夜裡的戰鬥
173.安飄蟲超越風之谷
174.果然翁之村
175.百變怪大師，與伊美蒂重逢
176.喵喵跟布盧跟布盧皇
177.阿利多斯，忍術戰鬥
178.展翅，陽陽瑪，飛向明天的天空！
179.皮卡丘與皮丘
180.毽子花，草系神奇寶貝的戰鬥
181.黑魯加跟波克比
182.燒焦塔，小松登場
183.圓朱道館，鬼斯戰鬥（小智得到魅影徽章）
184.伊布五姐妹，茶會大戰鬥
185.黑暗鴉，被奪走的徽章
186.鐵炮魚的天空
187.熊寶寶的秘密
188.凍僵的向日種子之迷
189.挖這裡，小山豬，尋找溫泉
190.急凍鳥vs胖丁，暴風雪之中
191.風速狗與火之石
192.土龍弟弟全都沒了
193.果然翁遇難了
194.小剛暈倒？危險的露營事件！
195.大力鱷抵抗水箭龜相撲大戰鬥（小智的貓頭夜鷹本集離隊後歸隊，卡比獸本集歸隊後離隊）
196.與神奇寶貝講話神奇寶貝的語言神奇寶貝的心情