這個問題遠沒有這麼簡單。基因組學發展到今天,圍繞它的討論和爭議,從結構和功能基因組學,到生命進化,一直到哲學,甚至到學術資源政治版圖的劃分,可以寫上一個很有趣的故事。
存在即合理。
這個沒錯。
但是,存在即有用嗎?譬如我們的闌尾和智齒,它們用處不大,麻煩不小,更多地是人類進化過程中留下的遺蹟,絕非什麼寶貝。
人類基因組中98.5%的非編碼序列,也要辯證地來看。
早在20世紀六七十年代,人們就開始把非編碼序列稱為“垃圾dna”了。
然而人們很快就發現,不少非編碼序列跟基因的轉錄調控密切相關。
垃圾並不垃圾,生命也絕非僅有中心法則。
那麼非編碼序列中都有些什麼好東西呢?教科書中經典的非編碼dna元件,如啟動子和增強子,可動遺傳因子,還有具有生物活性的小a。
分子生物學發展的早期,科學家為了窺破生命這一黑箱,所設計的精妙絕倫的生物化學實驗,實在令後生拍案叫絕!
而在這高通量、大資料為王的新世紀,非編碼dna研究的主力毫無疑問是 encode計劃。
這是全球大規模合作的科研專案的典範,生物大資料的先驅。
全球數十個科研團隊,用最新開發的高通量實驗方法,系統地,全面地掃描人類和其他生物各種組織中所有非編碼dna的生物活性。
他們用的方法有chip-seq(檢測染色質和蛋白質的相互作用),a-seq(把細胞裡的所有a分子作為一個整體測序),dnase-seq(把染色質上對dna酶敏感的區域,也就是結構較疏鬆較暴露的區域給測序),等等等等。
可惜當時還沒有crispr,否則檢測基因組區域的功能(不管編碼非編碼)是非常地合適(canver et al., 2017)。
現在人們已經開始跟進了。
2012年,encode的研究成果集中噴發。
《科學》雜誌社的評論家elizabeth pennisi總結道:“本週有三十篇論文在《自然》、《科學》等期刊上發表,宣告了垃圾dna這一理論的死刑。encode計劃已經發現,人類基因組的80%是有用的。”
當然,後面也出現了不少推翻甚至是針對性的言論,常威因為自己的學識還不夠,所以不敢妄自下判斷。
開什麼玩笑,一個時代的智者想要超越一個文明的積累,找到終極答案,那是多麼天荒夜談的事情?常威也絲毫不覺得自己是天才,有媲美愛因斯坦的靈感,如果說知識的積累的話,那常威倒是不缺。
但是他覺得大部分知識對於自己來說可能就是放在腦子裡面積灰,而不是互相碰撞,激發出靈感的火花。