畢竟在他看來，現在的兵部實在有些粗疏。許多部門都應該設定，滿足作戰需求。
只是他不想加強兵部，所以才暫時放下這件事，只為兵部新設一個軍械司，沒有增加其他部門。
戚昌國、李順祖對南鎮撫司的事務還算了解，聽到皇帝做出這麼大的改變，很快就明白如果這些部門能夠完善，錦衣衛完全能拋開兵部，獨自運轉起來。
這讓他們心中很是激動，詢問道：“陛下，司務廳、人事廳、後勤廳、裝備廳、訓練廳這五廳是什麼品級，設定多少官員？”
朱由檢仿照後世的級別，說道：
“廳長正六品，副廳長從六品。這是基礎級別，可以加銜提升。”
“廳下可以設處，處長正七品，副處長從七品。”
“還可以根據需要設科，科長正八品，副科長從八品。”
“還可以根據需要設股，股長正九品，副股長從九品。”
“除了一正二副之外，其餘人員伱們按需求設定，到時候詳細報上來！”
“這件事由人事廳負責，人事廳下可以設編制處，確定各機構編制品級和官員數量。”
“任務完成後編制處可以降為科或股，負責統計錦衣衛吃俸祿的人員數量和俸祿總額，防止違規超編。”
這種任務完成後降低階別的做法，顯然要控制官員數量。戚昌國、李順祖急忙記下，又詢問其它問題。
朱由檢一一解答，讓他們儘快把五廳設立起來，全面接掌錦衣衛。錦衣衛所有人員都要審查，按以往的功績和世襲官職品級，重新進行任命。
聽到皇帝的這些調整，鄭士毅知道南司房才是實際掌管錦衣衛的衙門，人員升調、錢糧發放等等，今後都由南司房掌管。
自己這個錦衣衛指揮使聽著好聽，實際上除了所謂的偵緝總隊之外，完全沒有實權。
理論上他這個錦衣衛掌印也能插手南司房，但是皇帝親口囑咐的事情，他能隨意插手嗎？
這讓他的心中，隱隱有些失落。
朱由檢也考慮到這一點，又向眾人說道：
“東司房、西司房都有關防，南司房也要鑄造關防大印，獨立辦理公務。”
“另外，朕已命人專門為錦衣衛鑄造密封銀印，所有獲得銀印的錦衣衛官員，都能用銀章密封上奏。”
“這些密摺會由專人保管，直接送到御前，任何人不得阻攔或者中途觀看。”
“三司房提督都能獲得銀印，只要宮門開啟，就能請求覲見。”
“其他人能否獲得銀章，就看你們表現。”
這讓鄭士毅心中好受了一點，知道自己以後不用透過東廠太監，就能和皇帝進行交流。錦衣衛依附東廠的局面，很有可能改變。
錦衣衛有兩司房，督察不法者號東司房，掌衛事者領之，權最重。
其次則西司房，提督巡捕。
北鎮撫司，專治詔獄。
南鎮撫司，專理軍匠。（改為南司房）。