韋塔島（Wetar島）中北部沿海的拉利基（Lalikki）地區有金礦，黃金儲量30噸以上，銀儲量800噸以上，在金礦區還有大型重晶石礦。韋塔島東部的羅芒島（Romang島）西部海灣附近有鉛鋅銀礦，鉛品位高達63％左右，鋅品位1.2％左右，銅品位0.55％，銀品位高達560克/噸左右。
（三）努沙登加拉群島
努沙登加拉群島（NusaTenggaraIslands，又名小巽他群島）主要有北支的巴厘島、龍目島、松巴哇島、科莫多島、弗洛勒斯島、阿洛群島和南支的松巴島、薩武島、羅地島、帝汶島等島嶼組成。
龍目島（Lombok）大部分河流的泥沙中都有砂金，東部、南部、西部沿海有巖金礦、鉛鋅礦，另外島的南部沿海還有幾百萬噸的鋁土礦。
松巴哇島（Sumbawa）的西部是金礦區，森林、河流、湖泊下面的泥沙裡都有砂金，今松巴哇島西部有7000個私人砂金礦，每年的非法黃金交易達50億美元，因島民大多用混汞法提金，島上的汞汙染極為嚴重，島民的平均壽命不足50歲。島西南端塞德佐龍（Sedjorong）東北11公里處有BatuHijau銅金礦，該礦為超大型銅金礦，銅儲量在450萬噸以上，黃金儲量在390噸以上、銀儲量770噸以上。在棟普（Dompu）西北11公里的地方有Onto銅金礦，該礦於2013年發現，也是個超大型銅金礦，銅儲量700萬噸以上，黃金儲量400噸以上。
弗洛勒斯島（Flores）有金礦、鎳礦，金礦主要分佈在島西端的拉布汗巴焦（LabuanBajo）。
龍布陵島（Lomblendao）的鮑拉賈（Bauraja）地區有金多金屬礦，該礦於1986年發現，黃金品位15克/噸，伴生銀、銅、鉛、鋅。
阿洛島（Alor）東中部的朗託卡（Lantoka）地區有金礦、鉛鋅礦、錫礦，還有高嶺土礦。
帝汶島（Timor）主要的礦產有金礦、錳礦、鉻鐵礦。帝力城西的科莫洛河（Comoro河）上游及其支流就有砂金礦。巖金礦主要分佈在帝力城南30公里山區的毛比塞地區（Maobisse）、圖裡塞地區（Turiscai），銅金礦主要分佈在島東部的奧蘇地區（Ossu）、格利卡地區（Quelicai）。鉻鐵礦主要分佈在北拉克洛河（RibLaclo河）上游的巴塔拉地區（Batara）。錳礦主要集中的島的西部和北部沿海，僅古邦（Kupang）周圍就有數億噸可露天開採的錳礦，錳品位在65％左右，中國有多家公司在古邦周邊投資了錳礦。北海岸馬納圖託省（Manatuto）東20公里的弗馬塞地區（Vemasse）也有近億噸的錳礦，錳品位在56％左右。在西帝汶島的臘尤山有磷礦，五氧化二磷品位在18％左右。島上石灰岩分佈廣泛，如帝力東邊的馬納圖託省的石灰石礦中氧化鈣品位在53％以上，屬於高品質石灰石礦。在東帝汶的阿伊萊烏（Aileu）地區有高嶺土礦、膨潤土礦。
東帝汶所屬的阿圖魯島（Atauro，也稱阿陶羅島）有零星的小型金礦、鉛鋅礦。
（四）巴拉望島
巴拉望島曾一直是中國的島嶼，元代郭守敬在島上建立過天文觀測站，明代鄭和下西洋的時候，曾在島上設立過遠洋基地。
巴拉望島的礦產主要是鎳礦、鉻鐵礦、汞礦。島的南部有三大鎳礦，分別是位於里奧圖巴河（RioTuba河）中游的RioTuba鎳礦、位於巴通巴通（Bato-Bato）海岸的Citinickel鎳礦及位於西海岸奎松（Quezon）的Berong鎳礦，僅里奧圖巴鎳礦的礦石量就達4億多噸，鎳品位1.5％以上，含銅、鈷、金。島南部的鉻鐵礦礦體長135公里，寬25公里，分佈範圍1500平方公里，三氧化二鉻品位在42％左右，可以直接冶煉鉻鐵，也能用於耐火材料。
巴拉望島的汞礦位於島東南部的索夫羅尼奧（Sofronio）山谷，汞儲量在3000噸以上，今菲律賓停止開採巴拉望島的汞礦後，在那裡留下了一個長2.5公里、寬550米的礦坑）。
巴拉望島有很多石灰岩質、石英石質山脈，因此石灰石礦、石英石礦資源十分豐富。