最後是政治恐怖，1793年9月17日頒佈的懲治嫌疑犯條例授權救國委員會將與政府為敵的人，不論是聯邦黨、朱安黨還是教士，一律加以逮捕。
而10月開始，雅各賓派將自己的全部敵人不加區別的一律處死。吉倫特派的領袖一一人頭落地，除了少數逃亡國外的。國民公會不但在巴黎殺人，還派出特派員到外省去殺人。
巴拉斯和費雷隆在攻佔土倫後實行過大規模集體處決。在南特，國民公會特派員卡利耶別出心裁的讓人設計製造一些艙底活動的船隻，先後將數千名南特人淹死在冬日的盧瓦爾河中。不少民眾開始懷念路易十六的溫和統治，開始寫信給路易十六，請求他的庇護。路易.查理截獲了這些信件，下令把這些恐怖的事件對其家人封鎖訊息。
為了保衛自己一家人的安全，路易.查理把已經組建完成的兩隻近衛師分別駐紮在巴黎工業區和楓丹白露宮，並要求在工業區內再組建兩隻預備役師。
不過雅各賓分子似乎暫時遺忘了離開政治中心的前國王一家，他們忙著對付國內外的敵人，和爭奪吉倫特派被打垮後的政治權力。雖然有小部分無業遊民想糾叢集眾去抓捕前國王一家，但是他們在半路上就被近衛師的前哨擊潰了，而領導者則迅速被肅反委員會秘密逮捕處死。
拿破崙離開巴黎時收到路易.查理的贈禮和回信後，顯然很高興，在93年陸陸續續的給路易.查理寫了幾封信講述自己的近況。
一直到93年10月，拿破崙告訴路易.查理，他被同鄉國民公會圍攻土倫部隊的特派員薩利希蒂的推薦下，成為了圍攻土倫部隊的炮兵副指揮後。路易.查理才驚奇的發覺，原來這位拿破崙中校就是他記憶中的未來法國皇帝拿破崙.波拿巴。為了和未來的法國皇帝拉近關係，路易.查理仔細詢問了土倫戰役中敵我軍隊的數量、佈置和進攻，還誠懇的請教拿破崙對土倫戰役的作戰計劃。
隨後路易.查理就按照拿破崙的來信，不斷的和聖西爾軍校的參謀士官生們進行敵我兩方的推演。這次推演一直持續到1793年12月19日，土倫被攻佔為止。
透過這次推演，未來的參謀軍官們意識到了，雖然這次勝利歸功於拿破崙本人的天才作戰計劃，但是敵我兩軍層出不窮的意外事件，導致了這個計劃的差點失敗。
最後拿破崙雖然取得了攻佔土倫的勝利，但不是因為法軍的作戰計劃太成功了，而應當歸功於法軍犯得錯誤比土倫聯軍犯的錯誤更少。根據這個結論，軍隊的素質、後勤供給和合理的組織安排計劃決定了戰爭勝負的關鍵。
而在戰略上透過這場戰役，英軍最後大多能全身而退的結果來看，軍官們認識到光靠陸軍是打敗不了英國人的，而擁有一支強大海軍的英國，在英法開戰前已經居於不敗之地，那麼根據這個結論去推演英法戰爭，法國失敗只是一個時間問題。
路易.查理看過這份最終討論出來的結論後，並沒有寄給拿破崙，而是下令封存在近衛師參謀部內，並把土倫戰役的各個得失當做案例在軍校內進行教學。
到了94年春天，法國內外敵人暫時退卻了，國內形勢終於開始好轉了。而路易.查理則開始檢討93年商業聯盟的工業成就。
這一年，法國煤產量已經達到了350萬噸。而鐵產量則已經近50萬噸，粗鋼3萬噸。而水泥產量14萬噸。新增加水泥道路897公里，塞納河和萊茵河水系的運河已經完成開始通行了。除了煤以外，法國的鋼鐵第一次超過了英國人，而水泥現在還是法國特產。
雖然全民皆兵的總體戰政策影響了商業聯盟的工業發展，但是也促進了蒸汽機等機器的大面積推廣，以替代人力不足。而蒸汽明輪船、水泥道路和橡膠輪胎的出現促進了法國交通運輸業的發展。
工業發明方面，120噸水壓機試製成功，而科學院下一個目標是1200噸的水壓機。根據科學院的研究，鋼鐵的區別主要在於含碳量的多少，而鋼材的效能則取決於微量元素。
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