因此，當從傾向天主教豐臣秀吉那裡獲取了更大的期望之後，把豐臣秀吉的九州平定，當作解放所有受島津氏壓迫的天主教大名的聖戰，之後揮軍渡海，消滅異教大明——這無疑有著更為崇高的宗教意義。
天正十五年（1587年）一月一日，豐臣秀吉向畿內和北陸、東山、東海、山陰、山陽等道等約四十個令制國下達了作戰命令，總兵力二十五萬人的各地軍隊，開始陸續向大阪城集結，最終在三月份的時候，所聚集到的兵力達到了二十四萬人。這是扶桑國內戰爭史上最大規模的一次單向出兵，其後的小田原之戰只有二十一萬餘人，而大坂之戰德川方最大出兵規模也僅僅只有大坂冬之陣的二十萬。
豐臣秀吉以超過關原之戰雙方總兵力的軍隊規模，向勉強只有五萬餘眾的九州島津家攻去。以二十多萬人的出兵規模，配屬三十萬人和二萬匹馬一年份的糧草，這也明顯不是單純為了討伐島津家。而兵力不到小田原之戰北條家三分之二的島津家，碰上兵力還要超出的九州平定軍，下場可想而知。
當時在大坂的教士們目睹了秀吉的出陣，他們無以形容其偉大，只能說那是如此豪華。
天主教大名麾下將士佩著十字架盛裝前行的光景，令傳教士們目不暇接，獲得了極大的滿足。天主教大名在出陣之際前往教會進行懺悔（confisso），拜領聖體（communion），做好了戰死的準備。豐臣軍行軍的一路之上，不論海路、陸路，隨處可見繪著十字架的旗印、指物在風中翻飛。短短一個多月，島津家在九州的勢力土崩瓦解，島津第十六代家督島津義久剃髮向豐臣秀吉降服，將家主轉給了弟弟島津義弘。豐臣政權和天主教的關係在這個時間內達到了頂峰。
不過很遺憾，當年的天主教並不是後世所看到的天主教那樣。
作為排他性極強的宗教，當年的天主教所作所為，與後世的宗教極端組織相比，可謂是有過之而無不及。
天主教的傳教士僅僅因為大明人不信教，就能幾十年如一日的試圖挑起戰爭。那麼原本並非天生就是基督徒的當時的扶桑人，在九州天主教勢力強盛的地方，下場也就可想而知。當豐臣秀吉實地勘察作為徵明基地的九州之時，天主教勢力所及之處的現狀，令這位從未見過天主教真面目的天下人大為震驚。
以最早的天主教大名大村純忠作為例子，其領地範圍內氛圍可以說與宗教極端組織控制區有過之而無不及，如同後世的宗教極端分子爆破巴米揚大佛、推平亞述古蹟、炸燬約拿墓（基督教先知）、對非穆斯林舉起屠刀······
這些古代的宗教極端分子和狂信徒們，為了所謂的純潔天主教領土，不僅在領內禁止信奉其他宗教之人居住，還強迫當地民眾進行改宗，以及破卻寺院神社，甚至向著手無寸鐵的僧侶、神官舉起屠刀。
大友純忠甚至連自己身為佛教徒養父的墓地都沒放過，為更好的為上帝服務，這位虔誠的天主教徒把拒絕改宗的治下領民，直接賣給了上帝的牧羊人。
作為後世穿越而來的清定，非常清楚葡萄牙人、西班牙人等西方國家的傳教士有著什麼樣的野心、目的，這也是為何上杉家幾乎不與傳教士打交道的緣故。
“尊貴的大人，在下與耶穌會傳教士不同，對他們的所作所為嗤之以鼻。信仰是自由的，並非強制的，更不能厭惡甚至敵視他人的信仰。為此在下建立了屬於自己的教會——扎比教。”扎比·.布萊克索恩一邊手舞足蹈，一邊說著。
“恩？並非天主教嗎？”清定在聽完扎比·.布萊克索恩的話後才減輕了一絲敵意。
“不錯，在下發現耶穌會在各國的所作所為已然背離了傳教的初衷，更背離了‘絕財’、絕色、‘絕意’的三願。為了拯救世間的勞苦大眾，在下只能創立新的教會。當然，這需要您的支援。”扎比·.布萊克索恩點了點頭後緩緩說道。
“餘本就倡導信仰自由，也不主動進行干預，只要在餘治下之地安分守法即可。”清定對宗教方面的要求其實不高，只要遵守最基本一條——守法。
“那真是太好了，先前在下曾在南九州的薩摩、大隅、日向等地進行傳教，但收效甚微。那裡的領主只看重在下的武器、科學技術，對在下的教會並不感興趣。”扎比·.布萊克索恩有些無奈的說道。
“無妨，餘許可你進行傳教，但還是要觀察一段時日。”清定對這個新興的教會扎比教了解不多。
“多謝尊貴的大人，為了感謝大人許可在下傳教，在下願意將停泊在堺的卡拉克（Carrack）上一門重炮相贈。”扎比·.布萊克索恩激動的說道。
“先別急著謝，你傳教之地餘之後會派人通知你的。”清定與大友宗麟不同，不會拿了傳教士的好處而默許傳教士肆意妄為的。
畢竟，前不久的土佐幡多郡就是一個最好的例子。
大友家派去支援一條兼定的軍勢不僅大肆破卻寺院神社，還殘害僧侶、神官，更有甚者還搶佔大量土地準備作為耶穌會之地。
若不是土佐國司一條·大友聯軍慘敗於四萬十川之戰，恐怕幡多郡的絕大部分地區就要淪為天主教會的控制區了。
對於一條兼定的引狼入室之舉，清定可不打算輕易饒恕。
先前，清定已經給了長宗我部元親、宇都宮豐綱二人一個面子，不再追究長宗我部家庇護一條兼定的長男一條內政之事。
但一條兼定的所作所為已經徹底喪失了土佐一國的人心，甚至能用罄竹難書來形容。
隨後，清定就下令將一條兼定流放至蝦夷地，交由松前家進行看管。