顧雲飛也沒有為難他，繼續率大軍過襄陽，朝延安府奔襲而去。
陝西此時正被回軍折騰的天翻地覆，關中地區已十里無人煙，雞犬不相聞，不論是州府還是村莊，所有的漢人都被回軍屠殺的乾乾淨淨，村村血流成河，屍骨遍地。
陳玉成北上河南尋到叔叔陳得才和賴文光部後，這才得知了回軍慘絕人寰的暴行，太平軍本來與回軍相互扶持，共同進攻西安，但是回軍在漢中的所作所為，讓兩軍間產生了巨大的分歧，太平軍也是有血有肉的漢人，當然不能為了一己之私眼睜睜的看著同胞被殺，最後回軍和太平軍發展到刀兵相見的地步，陳得才不想再趟這趟渾水，便於賴文光商議後，回撤到了河南洛陽。
陳玉成心裡著急南京的安危，也顧不上進軍陝川的計劃，當下率陳德才和賴文光的兩萬騎兵南下回援南京。在經過壽州時，恰好碰上李秀成率領的北伐大軍，二人雖有間隙，但是為了太平天國的安危，暫時放下了私人仇怨，再次攜手。李秀成分兵十萬，由陳玉成率領進攻安慶府，他則帶著另外的十萬大軍進攻六安府，二人一南一北朝湖北夾擊而去，六安府和安慶府便是擋在湖北之間的釘子。
曾國藩在得知此軍情後，差點驚暈了過去，湖北兵力空虛，湘軍都集中在南京周圍的戰線上，若是讓李秀成得逞，奪取湖北，必然會長驅直下直逼長沙，到時候南京城打不下來，自己的腦袋怕也要被朝廷拿了去。
思前想後，曾國藩還是給雨花臺的曾國荃發了十萬火急的軍報，令曾國荃做好準備，一旦六安和安慶有失，便迅速回撤救援。
陳玉成不愧為太平軍的一員悍將，只用了三日便接連攻城拔寨，進攻到安慶城外。在安慶城丟失一年後，再一次來到這個讓自己兵敗垂成的地方，陳玉成心裡生出無數的感慨。
安慶城被李鴻章四處招募兵勇組成淮軍南征上海後，已經沒了兵源，曾國荃又率湘軍進攻南京，安慶城內的守軍僅有一萬多人，而且都是些裝備老舊的老弱病殘。
陳玉成吸取了上次救援安慶的教訓，穩紮穩打，並不急於求成。在安慶城外築壘設壕，連營數十座，層層排排，把安慶城圍了個水洩不通，徹底斷掉了城內的糧草來源。
安慶城周邊的小股湘軍經過幾次的救援後，都被陳玉成打的落敗而歸，再也不敢與陳玉成硬碰。經過十幾天的圍城，城內斷糧斷水，守衛的湘軍經不住飢渴的煎熬，開城納降。
陳玉成幾次想下令把湘軍屠滅，以祭奠安慶太平軍降將的在天之靈，當年曾國藩在安慶城屠殺了數十萬的太平軍和百姓，陳玉成就是再恨他，也下不了這種泯滅人性的命令。
李秀成進攻六安府則沒有這麼順利，清軍在各城堅持深溝高壘政策，避戰不出，加上連日大雨，太平軍士氣低落，疾疫頻生，缺糧斷草，李秀成基本上沒能攻下一座城池，繞道奔襲道六安城下，在進攻十幾日沒有結果後，遂率大軍經壽州又回撤到了南京城。
陳玉成拿下安慶府後，立即在各方掀起軒然大波，南京城內的太平軍連吃敗仗，一時軍心大振，連病態龍鍾的洪秀全也似迴光返照一般，破天荒的召集文武官員上了早朝，狠狠嘉獎了陳玉成一番，並恢復了陳玉成的爵位，將太平天國各王全部交予陳玉成都統，連忠王李秀成也要受他的節制。
李秀成打了敗仗，自然沒臉反駁，但還是一肚子的怨氣沒處發，陳玉成的兵馬也是他調撥的，再怎麼說也有他的一半功勞，陳玉成不過是運氣比他好點，可嘆洪天王如今是隻認結果，不重過程。
與李秀成有過節的各王也趁機落井下石，尤其是洪秀全的哥哥洪仁發、洪仁達更是變本加厲的想要將李秀成的兵權據為己有，在洪天王面前肆意詆譭李秀成的過失。
洪天王本來就看李秀成不順眼，當初就是李秀成決議攻打上海，不停他的詔令，這才導致瞭如今太平天國日落西山的局面，後來下詔各王回京馳援時，李秀成也是百般的拖延，如今有陳玉成獨擋一面，洪天王也用不著依靠李秀成了，經過與兩個無能奸猾的哥哥商議後，第二日便詔令將李秀成調往常州，手下的兵馬歸洪仁玕調遣。
李秀成真是憋了一肚子的願望，他對洪天王從無二心，一心想振興太平天國的大業，沒想到卻受人猜忌，落得如此下場，在抵達常州駐防後，心中鬱憤便又有了建功立業的想法，妄圖再一次在蘇南一帶打出威名，讓洪天王另眼相看。於是在常州整頓了三日的兵馬，發密報讓堂弟李世賢在浙江配合呼應，三日後李秀成親率大軍南下，只逼蘇州的門戶無錫城。