專員們援引古羅馬時代的將軍們的榜樣，勸他服從命令。他回答道：“我們引用一些東西，經常是引用錯了。如果用古羅馬的將軍們的事例來做寬宥我們罪行的藉口，那是曲解歷史。羅馬人並沒有殺掉塔克文；羅馬人的共和國很有秩序，而且有良好的法律；他們既沒有雅各賓俱樂部，也沒有革命法庭。我們現在是一個無政府的時代；這些老虎要我的腦袋，我不願給他們。”
於是卡睦向他說：“公民將軍，你肯不肯服從國民公會的命令到巴黎去？”他回答道：“在這個時候不行。”卡睦說：“好，我現在宣佈撤銷你的職務，你現在不是將軍了，我命令把你帶走。”迪穆裡埃說：“這太過分了！”於是他命令德意志籍輕騎兵把專員們逮捕起來，交給奧軍作人質。
迪穆裡埃同夏爾特公爵、圖弗諾上校一起，連同貝爾希尼的兩個騎兵隊投奔了奧國軍營。他的軍隊的其餘部分投到法馬爾軍營，編入當皮埃爾指揮的軍隊。
國民公會在得到專員被捕的訊息以後，立即宣佈長期復會，宣佈迪穆裡埃為賣國賊，並下令通緝他，獲其首級者有賞，同時決定成立救國委員會。吉倫特派被指控為迪穆裡埃叛變的共謀分子。
雅各賓派爭得了透過成立革命法庭的法令；他們利用人們對羅蘭的不滿，把它逐出內閣，最近又戰勝了迪穆裡埃。現在，他們只剩下奪取吉倫特黨的最後一個陣地——國民公會了。他們是在4月10日開始這項活動的，到6月2日結束。
羅伯斯比爾在國民公會上指名控訴布里索、加代、韋尼奧、佩蒂翁、讓索內；馬拉則在群眾中譴責這些人。
馬拉以雅各賓派主席的資格向各郡發出一項宣言，要求各郡發動聲勢浩大的請願和控訴運動，反對賣國賊和那些不忠誠的議員。國民公會中的右派和平原派感到有聯合的必要，他們把馬拉送上了革命法庭。這個訊息使巴黎各俱樂部、群眾和公社大為不滿。
當馬拉被革命法庭判處無罪時，吉倫特派就陷入了被動。6月2日，馬拉在市政廳敲響警鐘，號召群眾集結，雅各賓派組織了8萬人圍攻了國民公會。雖然其中大多數人根本不知道自己是來幹嘛的。
馬拉代表雅各賓派要求國民公會宣佈拘留的吉倫特黨人有讓索內、加代、布里索、戈爾薩、佩蒂翁、韋尼奧、薩爾、巴巴盧、尚邦、比佐、比羅朵、李敦、拉博·拉蘇斯、朗熱內、格朗熱納夫、勒阿底、勒薩日、盧韋、瓦拉澤；外交部長勒布倫、財政部長克拉維埃和十二人委員會的成員：克爾維勒岡、加迪安、拉博·聖艾蒂安、布瓦洛、貝特朗、維熱、莫勒沃、亨利·拉里維埃、哥麥爾和貝戈安。6月2日之後，吉倫特派土崩瓦解了，其他黨人紛紛逃離了巴黎。而夏洛特·科黛為了拯救共和國刺殺了馬拉。
同時，里昂發生了暴動，馬賽和波爾多也出現了武裝叛亂，除了北部和東部法國。並有三十多個郡響應了暴動。
保王黨特別想領導里昂的暴動，把里昂變成南方的行動中心。這個城市是非常留戀舊秩序的，那裡的絲綢廠、金銀刺繡廠、奢侈品貿易，都使它依附於上層階級。因此，它很早就反對那打亂舊關係、貶低貴族和僧侶的地位、破壞工廠的社會變革。
當巴黎6月事件爆發後，且傳來了卡爾瓦多斯郡暴動的訊息，里昂人受到鼓舞就不再猶豫地舉起反叛的旗幟。他們在全城設防，構築工事，組成了一支兩萬人的軍隊，收留了逃亡分子，把軍隊交給保王黨普雷西和維里歐侯爵指揮，並與撒丁國王共同策劃軍事行動。
土倫，尼姆、蒙託邦和南方的主要城市很快地採取了同樣行動。自從皮塞侯爵率領少數軍隊混入吉倫特黨以後，卡爾瓦多斯郡的暴動也有了保王的性質。當時，波爾多、南特、布勒斯特、洛里昂各城，都同情6月2日被處死的人。
旺代軍初步獲勝後，佔領了佈雷絮爾、阿讓通、土阿爾。他們在完全控制本境以後，企圖佔據邊境關隘，開啟通向革命的法國以及同英國取得聯絡的道路。
6月6日，由四萬人組成的旺代軍在卡特利諾、萊斯居爾、斯托夫萊、拉羅什雅克蘭的指揮下向索謬爾進發，猛力攻下該城，並準備攻佔南特，以期更加穩固地保有旺代郡，控制盧瓦爾河。卡特利諾率旺代軍在索謬爾留駐部隊後，繼續進佔翁熱，渡過盧瓦爾河，佯作進攻圖爾和勒芒，突然轉趨南特，然後從右岸配合夏雷特從左岸同時向南特進攻。